Zračna luka Mostar otvorena je za civilni promet i to isključivo domaćeg karaktera. Tadašnji prijevoznik JAT je ubrzo uspostavio zračnu vezu Mostara sa Beogradom, Zagrebom i Podgoricom.
Iako je popunjenost kapaciteta u tom razdoblju bila je solidna, ona još uvijek nije bila ekonomski opravdana. Također, PanAdria je šest puta tjedno letjela na relaciji Zagreb-Split- Mostar-Dubrovnik i obratno, a prevozila je poštu, tisak i putnike, piše Klix.ba.
U razdoblju pripreme za Olimpijske igre, mostarska zračna luka je bila alternativa sarajevskoj i tako je dobila status međunarodne. U sklopu priprema za ZOI vrši se opremanje kontrole letenja, a u isto vrijeme nabavljena je i instalira nova meteorološka oprema.
Nakon završetka Olimpijskih igara zanimanje za zračnu luku raste, a uglavnom zbog blizine svetišta Međugorja. U to vrijeme se pojavljuje novi domaći prijevoznik Adria Airways iz Ljubljane koji se intenzivno uključuje u redoviti prijevoz za Zagreb i Ljubljanu. Istovremeno kompanija Aviogenex iz Beograda povezala je Mostar sa svijetom i to organiziranim charter letovima za prijevoz hodočasnika iz Irske i ostalih država Europe.
Rekordan broj prevezenih putnika mostarska zračna luka imala je 1990. godine – 86.000 putnika, od čega je 80 posto bilo za Međugorje. Danas je promet nešto manji i posljednjih godina održava se između 50 i 75 tisuća putnika godišnje.
Uspostavljanjem novih linija od svibnja sljedeće godine prema Njemačkoj očekuje se udvostručenje broja putnika koji će proći kroz terminale Zračne luke Mostar.
